Fermentation colique
Nos modèles de fermentation
Modèles dynamiques
Reproduction in vitro de la fermentation colique grâce au système ARCOL (pour ARtificial COLon) qui est un système de digestion artificielle dont le principe repose sur la culture d’un microbiote fécal, simulant les principaux paramètres physico-chimiques et microbiens du côlon.
Configurations disponibles :
– Côlon mono ou tri-compartimenté : ascendant, transverse et descendant
– Simulation du compartiment luminal seul ou associé à un compartiment mucosal
Principaux paramètres reproduits : pH, température, temps de transit, potentiel d’oxydo-réduction, conditions anaérobies, activité fermentaire du microbiote
Modèles statiques
Reproduction in vitro de la fermentation colique grâce à des systèmes statiques en fiole reposant sur la culture d’un microbiote fécal et reproduisant les principaux paramètres physico-chimiques et microbiens du côlon. Cette approche permet l’évaluation rapide et le criblage simultané de nombreux produits, formulations ou conditions expérimentales.
Configurations disponibles :
– Simulation du compartiment luminal seul ou associé à un compartiment mucosal
Principaux paramètres reproduits : pH, température, conditions anaérobies, activité fermentaire du microbiote
Simulation de différents environnements coliques
Conditions physiologiques
– Impact de l’âge (nourrisson, adulte, sénior)
– Effet du type de microbiote
Conditions pathologiques ou dysbiotiques
– Obésité
– Syndrome de l’intestin irritable (IBS)
– Dysbioses intestinales
– Conditions spécifiques définies selon les objectifs du projet
Analyses complémentaires
Les études peuvent être complétées par une large gamme d’analyses permettant de caractériser la composition et l’activité du microbiote intestinal, les métabolites issus de la fermentation colique ainsi que les différents paramètres d’intérêt définis dans le cadre du projet.
Analyses du microbiote
– Dénombrement microbien
– Viabilité microbienne
– Suivi de souches d’intérêt
– qPCR
– Métagénomique
Caractérisation des métabolites de fermentation
– Acides gras à chaîne courte (AGCC)
– Lactate
– Succinate
– Autres métabolites microbiens
Analyses des gaz de fermentation
– Quantification de la production de gaz
– Composition des gaz produits
– Étude des phénomènes de surproduction gazeuse
Analyses spécifiques
– Développement d’analyses adaptées aux besoins du projet
Applications
Les modèles de fermentation développés par Digest-IV permettent notamment d’étudier :
– L’impact de produits alimentaires sur le microbiote intestinal
– L’effet de compléments alimentaires, prébiotiques et probiotiques
– Les interactions entre médicaments et microbiote
– La colonisation microbienne de l’écosystème intestinal
– La résilience du microbiote après perturbation
– Les mécanismes impliqués dans certaines pathologies associées au microbiote
Exemples de projets réalisés :
– Effet d’un complément alimentaire d’origine végétale sur la composition et l’activité du microbiote colique.
– Impact d’un traitement antibiotique sur le microbiote colique et sa résilience.
– Évaluation de l’effet d’un probiotique sur la résilience du microbiote intestinal après une perturbation induite par un régime pauvre en fibres.
– Reproduction in vitro d’un microbiote associé à l’obésité à partir de selles de donneurs sains afin d’étudier les mécanismes impliqués dans les dysbioses liées à l’obésité
– Étude de l’effet d’un complément alimentaire sur la modulation d’un microbiote dysbiotique associé à l’obésité.